Prediction and Validation of Promoters Involved in the Abscisic Acid Response in Physcomitrella patens

仅当从密切相关的有机体的 genomic 数据是可得到的， cis 规章的元素的察觉例如抄写因素绑定地点(TFBS ) ，通过 ortholog 保存的利用是可能的。一条其他的途径基于他们在共同调整的基因的倡导者的 overrepresentation 是 TFBS 的察觉。然而，这条途径通常受不了假积极的预言的高率。这里，我们用知道被植物激素 abscisic 酸(骆驼毛的织物) 强烈在模型植物 Physcomitrella 圣餐盘导致的基因的倡导者进行了案例研究，苔藓。通常认为的 TFBS 在一条严格的一致途径用三个 de novo 主题察觉工具被检测。产生主题从 microarray 表示介绍用数据被验证并且能在低劣敏感(33.33%) 与高特性(90.48%) 预言导致骆驼毛的织物的基因。另外，预言包含骆驼毛的织物应答的 TFBS 的 27 基因用即时 PCR 被验证。这里， 37% 基因的一个总数能被显示在骆驼毛的织物处理之上被导致，当 70% 被发现被骆驼毛的织物调整时。我们断定一致来临因为主题察觉使用合作规定信息能被用来识别在给定的刺激下面被调整的基因。以进化，我们发现自从涉及 transcriptional 规定的家庭诚实的第一陆地植物， ABA 反应显然被保存了。