TRANSCRIPTOMA DE C. arabica L. REVELA DIFERENÇAS NA EXPRESSÃO DE GENES ENVOLVIDOS NA BIOSSÍNTESE DA RAFINOSE

Coffea arabica L. e uma cultura importante em varios paises em desenvolvimento. Apesar de sua importância economica, os dados do transcriptoma minimo estao disponiveis para tecidos de frutas, especialmente o perisperma, onde varios compostos relacionados a qualidade do cafe sao produzidos. Para compreender os aspectos moleculares relacionados ao desenvolvimento de frutos e graos de cafe, relatamos uma analise transcriptoma em larga escala de folhas, flores e frutos. O sequenciamento da Illumina (RNA-seq) resultou em 41.881.572 sequencias trimadas com alta qualidade. A montagem de novo gerou 65.364 unigenes com um comprimento medio de 1.264 pb. Um total de 24.548 unigenes foram anotados como genes codificadores de proteinas, dos quais 12.560 sequencias eram completas para esta codificacao ( full lenghts ). No processo de anotacao, identificamos nove genes candidatos relacionados a biossintese de oligossacarideos da familia da rafinose (RFOs). Estes acucares conferem osmoprotecao e sao acumulados durante o desenvolvimento inicial dos frutos. Quatro genes dessa via tiveram o seu padrao transcricional validado pela reacao em cadeia da polimerase via transcricao reversa quantitativa em tempo real (RT-qPCR). Este atlas transcriptomico de  C. arabica fornece um importante passo para a identificacao de genes candidatos relacionados a diversas vias metabolicas do cafe, especialmente aquelas relacionadas a composicao quimica dos frutos e a qualidade da bebida. Nossos resultados sao o ponto de partida para aumentar o conhecimento sobre as proteinas do cafe que sao produzidas durante os estadios de floracao e desenvolvimento inicial dos frutos.