Evolutionary dynamics of leucine-rich repeat receptor-like kinases and related genes in plants:A phylogenomic approach

2014 
像受体的 kinases (RLK ) , evolutionarily 相关的 LRR 像受体的蛋白质(RLP ) 和像受体的细胞质的 kinases (RLCK ) 有的充满白氨酸的重复(LRR ) 在植物发信号的重要角色,和他们的基因亚科与基因复制和损失的复杂历史大。在三个密切相关的系,包括 Arabidopsis thaliana 和 A。lyrata (Arabidopsis )( 荚) ,莲花 japonicus,和 Medicago truncatula, Oryza sativa ssp。装饰用的梨树,和 O。sativa ssp。indica (瑞斯) ,我们发现 LRR RLK 包括这些 LRR 相关的亚科的最大的组,当相关 RLCK 代表最小的组时。另外, orthologs 的比较显示 LRR RLK/LRR RLP/RLCK 亚科的相互的基因损失的高频率。而且, pairwise 比较证明相互的基因损失经常在其他的系与系特定的复制被联系。持续,在 A 的基因的分析。涉及开发的 thaliana 表明没有种类特定的复制,大多数是高度保存的 orthologs 并且从更旧的 Arabidopsis 特定或 rosid 特定的复制发源。我们为经历了经常的周转(复制,损失,和领域建筑学变化) 的基因讨论与功能的预言有关的潜在的陷井,并且基于种系发生的关系结束那预言将多半独自基于顺序类似超过那。
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