栽培花生 Aux/IAA 家族鉴定与生物信息学分析

2020 
Aux / IAA (Auxin / Indole - 3 - Acetic Acid) 家族是生长素 (Auxin) 信号的早期响应基因家族之一,广泛参与调控植物的生长发育。然而目前对于栽培花生 ( Arachis hypogaea ) Aux / IAA 家族的研究还未见相关报道。本研究在栽培花生中共鉴定到了 34 个 Aux / I AA 基因,分布在 15 条不同的染色上。多重序列比对分析发现花生  Aux / IAAs 具有 4 个保守结构域,分别为 I - IV 。聚类分析将花生 Aux / IAAs 分为 I - VIII , 8 个亚家族。各个亚家族内部基因具有相似的保守基序,而基因之间的内含子 / 外显子结构存在差异。基于基因表达模式分析将栽培花生分为 A 和 B 两组基因, A 组基因在花生各个组织的表达量都相对较高,而 B 组基因的表达具有组织特异性。基于以上结果,本研究将为进一步对 Aux / IAA 家族的基因功能研究提供科学依据。
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