Türkiye Anadolu Eşeği (Equus asinus)’nin Mitogenom Karakterizasyonu ve Filogenetik İlişkileri

2019 
Bu calismanin amaci, Turkiye Anadolu esegi ( Equus asinus )’nin ilk mitogenom karakterizasyonunu yapmak ve filogenetik iliskilerinin ortaya cikarilmasina katki saglamaktir. Anadolu esegine ait bir ornegin komple mitokondriyal genomu, Long-Range PCR ve Yeni Nesil Dizileme teknigi ile karakterize edilmis ve Bayesian, Maksimum Likelihood ve Neighbor-Joining metotlariyla filogenetik analizler yapilmistir. Komple mitogenom, 13 protein kodlayan gen, 22 tasiyici RNA, 2 ribozomal RNA ve bir kodlama yapmayan kontrol bolgesi (D-loop) iceren, 16.551 baz cifti uzunlugunda tipik dairesel DNA molekuldur. Mitogenomun ortalama nukleotid kompozisyonu, memeli mitogenomlari araliginda olup; adenin icin % 32.32, timin icin % 25.78, sitozin icin % 28.67, guanin icin % 13.23’tur; a denin+timin icerigi ( % 58.10 ), guanin+sitozin iceriginden ( % 41.90 ) daha fazladir. Toplam 14 tasiyici RNA, 12 protein kodlayan ve 2 ribozomal RNA geni agir zincir uzerinde kodlanmakta, 8 tasiyici RNA ve bir protein kodlayan gen (ND6) ise hafif zincir uzerinde kodlanmaktadir. Gen yapisi, organizasyonu ve kompozisyonu diger atgillere benzerdir. Filogenetik analizler, Turkiye Anadolu eseginin, Cin evcil eseklerine Avrupa evcil eseklerinden daha yakin oldugunu ve Afrika yabani eseklerinden (Somali yabani esegi gibi) koken almis olabilecegini gostermistir. Bu calisma, Turkiye esekleri ve diger atgilleri iceren gelecekteki molekuler calismalar icin Anadolu eseginin referans mitogenom verisini sunmustur.
    • Correction
    • Source
    • Cite
    • Save
    • Machine Reading By IdeaReader
    0
    References
    1
    Citations
    NaN
    KQI
    []