Existe-t-il encore des endocardites infectieuses non documentées microbiologiquement ?

Introduction L’endocardite infectieuse (EI) est une pathologie rare avec une letalite qui reste elevee malgre les progres diagnostiques et therapeutiques. Nous avons etudie l’apport des outils microbiologiques dont la biologie moleculaire dans la documentation des EI a hemocultures steriles. Materiels et methodes Nous avons mene une etude observationnelle prospective monocentrique d’aout 2015 a novembre 2019 dans un centre hospitalo-universitaire qui a une prise en charge standardisee et pluridisciplinaire des endocardites infectieuses. Nous rapportons les caracteristiques des patients ayant une EI a hemocultures negatives. Resultats Un total de 270 patients ont ete inclus, 71 % (192) d’hommes, d’âge moyen de 68 ans (±14,6). Quatre-vingt-dix-huit pour cent (266) avaient une EI certaine. Cinquante-six pour cent (153) des patients avaient une EI sur valve native, 29 % (80) sur valve prothetique (mecanique ou bioprothese) et 18 % (50) avaient une infection de sonde de pacemaker ou DAI avec ou sans atteinte valvulaire. La positivite des hemocultures (a l’exclusion des contaminants) a permis de faire le diagnostic dans 95,5 % (258) des cas. 34 % (93) des EI etaient a Staphylococcus aureus dont 5 % de SARM, 31 % (83) a Streptocoque dont 1% de Streptocoques deficients, 17 % (47) a Enterocoque dont 16% d’Enterococcus faecalis, 7 % (20) a Staphylocoque a coagulase negative, 1,5 % (4) a enterobacterie (infections de sonde de PM exclusivement), 1 % (3) de bacteries du groupe HACEK, 6 % (16) a un autre pathogene. Quatre (1,5 %) cas d’EI polymicrobienne et 1 cas d’EI fongique a Candida parapsilosis. Seulement 12 cas (4,5%) d’EI avaient des hemocultures negatives dont 10 ont ete documentes microbiologiquement. Sept des 12 cas avaient recu une antibiotherapie prealable dont les 2 cas restes sans documentation microbiologique. La serologie bacterienne a permis de documenter 6 cas (Coxiella burnetii = 2 et Bartonella = 4), l’ARN 16S 3 cas (Corynebacterium jekeium, Streptococcus groupe bovis, Bartonella sp), la metagenomique 2 cas (Coxiella burnetii et Bartonella henselae) et la culture standard (1 piece operatoire et 1 ponction disco-vertebrale) 2 cas. La mortalite a 12 semaines etait de 20 % (54) et a un an de 25 % (67). Conclusion La standardisation par une equipe pluridisciplinaire de la prise en charge des endocardites infectieuses a permis d’ameliorer le diagnostic et la prise en charge de ces patients. Les bacteries du groupe HACEK ayant longtemps fait partie des EI a hemocultures steriles sont identifiees dans les flacons d’hemocultures prolongees de meme que les Streptocoques deficients. La serologie bacterienne reste un outil utile et peu couteaux dans les cas de bacteries a croissance intracellulaire. La biologie moleculaire permet egalement de documenter de maniere fiable la grande majorite des EI a hemocultures steriles. La technique de l’ARN 16S et de plus en plus la metagenomique (NGS) constituent des outils diagnostiques precieux pour l’identification des pathogenes non retrouves en culture. Ainsi les cas d’EI non documentees microbiologiquement sont devenus anecdotiques avec une prise en charge optimisee de cette infection a letalite elevee.