Variabilité génétique des accessions d'igname Dioscorea alata L. introduites au Bénin à partir des Îles du Sud-Pacifique

2014 
Objectif : L’igname est l’une des plus importantes cultures vivrieres a tubercules en Afrique de l’Ouest, en particulier au Benin. Dans le but de renforcer la variabilite genetique des ignames cultivees D. alata (L.) au Benin, une collection de 21 accessions a ete recemment introduite des iles du Sud-Pacifique grâce a une cooperation CIRAD-Institut National de Recherche Agricole du Benin (INRAB). Le present travail a pour objectif d’evaluer la variabilite genetique au sein de cette collection afin de favoriser son utilisation rationnelle. Methodologies et resultats : Pour cette investigation, 10 marqueurs microsatellites et 17 traits agromorphologiques ont ete utilises. Une variation phenotypique significative a ete observee dans la collection, notamment au niveau de nombreux attributs qualitatifs. Sur le plan moleculaire, un total de 40 alleles a ete detecte avec en moyenne 4 alleles par locus. Neuf des 10 marqueurs microsatellites SSR utilises se sont reveles discriminants avec une valeur moyenne du Potentiel en Information du Polymorphisme (PIC) estimee a 0,239. Les similarites genetiques estimees entre les accessions varient amplement (0,11 – 0,87), suggerant qu’une importante diversite existe dans la collection. L’etude de la structuration de cette variabilite genetique permet de classer les accessions en trois classes phenotypiques et deux groupes genetiques differents au sein de la collection. Conclusion : Ces resultats ont montre que les accessions introduites sont morphologiquement et genetiquement tres diversifiees et contribuent donc significativement au renforcement de la diversite genetique des ignames cultivees au Benin. Mots cles : Agro-morphologie, Benin, D. alata , Diversite genetique, Iles Pacifiques, SSRs Abstract Objective : Yam is one of the most important tuber crops grown in West Africa, in particular in Benin. In order to reinforce the genetic variability of water yam D. alata (L.) cultivated in Benin, a collection of 21 accessions was recently introduced from the South Pacific Islands through the cooperation of CIRAD and National Institute of Agricultural Research of Benin (INRAB). The objective of this study was to assess the genetic diversity in this collection for favoring its rational use. Methodology and results : To conduct this investigation, ten microsatellites loci and 17 agro-morphological traits were used. A significant phenotypic variation was observed within the collection, mainly at many qualitative attributes. At molecular level, a total of 40 alleles was detected with an average allele number of 4 per locus. Nine of 10 microsatellites used were found to be discriminative with a mean value of Polymorphic Information Content (PIC) estimated at 0.239. Genetic similarities estimated between the accessions varied widely (0.11- 0.87), suggesting that an important genetic variability exist in the collection. The inference of the structure of such genetic variability revealed the existence of two genetic groups organized into three phenotypic classes within the collection. Conclusion : These results revealed that the introduced accessions are morphologically and genetically well diversified and thus will contribute significantly in reinforcing the existing local water yam genetic diversity in Benin. Key words: Agro-morphology, Benin, D. alata, Genetic Diversity, Pacific Islands, SSRs
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