Caractérisation par ingénierie génomique des profils d'expression génique de Pisolithus tinctorius et d'Eucalyptus globulus au cours du développement de la symbiose ectomycorhizienne

2001 
Les ectomycorhizes sont des associations symbiotiques etablies entre les racines des arbres et certains champigpons du sol. Ces relations mutualistes, dont les benefices sont avant tout trophiques, entrainent des modifications morphologiques et metaboliques importantes chez les deux partenaires. La formation de l'ectomycorhize Eucalyprus globulus-Pisolithus tinctorius s'accompagne egalement d'un changement du proteome et de l'expression genique des racines et du champignon. Afin d'acquerir une vision globale des genes exprimes et regules au cours de la formation de l'ectomycorhize E. Globulus-P. Tinctorius, nous avons developpe une analyse de l'expression senique dans l'organe symbiotique via l'analyse du transcriptome. Une premiere etude, nous a permis d'obtenir les profils d'expression de 400 ESTs (Expressed Sequer. . Ce Tags) dans une ectomycorhize en formation. Nous avons ainsi pu identifier 17% des ESTs qui sont regules par la symbiose. Nous avons poursuivi notre analyse sur plus de 700 ESTs au cours du developpement de l'organe symbiotique, depuis les premiers contacts entre les symbiotes jusqu'a la mise en place de l'ectomycorhize fonctionnelle. L'analyse statistique des profils d'expression nous il permis de mettre en evidence (i) des ensembles de genes co-regules (regulons) et (ii) une chronosequence dans l'expression genique. Parmi les genes fortement regules nous avons identifie : ceux codant les proteines parietales fongiques (hydrophobines et SRAP32), plusieurs familles de metallothioneines, des proteines de signalisation, des proteines de stress hydrique et des enzymes de la respiration mitocnondria. Le. Parmi ces genes regules, nous avons caracterise en detail, un gene codant une nouvelle hydrophobine, HydPt-3, et plusieurs genes de communication fongiques (ras, raf, calcineurine).
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