Análisis por técnicas morfológicas y secuenciación de ADN del polen atmosférico de la Comunidad de Madrid: estudios preliminares. Morphological analysis and DNA sequencing of atmospheric pollen in Madrid region: preliminary study

2016 
Hasta el momento, el estudio de las particulas biologicas en el aire que respiramos, se ha dirigido, principalmente, al conocimiento y control del polen y esporas, aeroalergenos cuyo impacto en salud es bien conocido. Recientemente la comunidad cientifica ha sugerido que el aire es un ecosistema en si mismo, que tendria su propia “aerobiota”, compuesta principalmente por virus, bacterias, esporas de hongos y polen. Para estudiar en conjunto toda esta biodiversidad en el aire urbano en la Comunidad de Madrid, surge el consorcio pluridisciplinar AIRBIOTA-CM, que integra a cinco grupos de investigacion de areas muy diferentes, que pretenden obtener una vision conjunta sobre la composicion y dinamica de las particulas biologicas del aire, optimizando los sistemas de muestreo y analisis. Las propuestas mas novedosas de las investigaciones iniciadas por este consorcio, son la utilizacion de tecnicas innovadoras de genetica molecular como la secuenciacion masiva aplicada en metagenomica (“Next Generation Sequencing”, NGS) y el uso de nuevas estrategias de captacion, como el empleo de aeronaves no tripuladas, para muestrear a diferentes alturas y en localizaciones geograficas urbanas que a priori puedan tener una composicion diferente de la biota y tengan una actividad humana relevante. El proyecto se inicia en otono de 2014, y los resultados preliminares que presentamos son los obtenidos mediante el analisis morfologico tradicional y el analisis del ADN del polen de una misma muestra procedente de un captador Burkard. Estos resultados evidencian que los captadores tipo Hirst utilizados por las redes aerobiologicas pueden emplearse tambien en los estudios de metagenomica, y que los datos obtenidos mediante la aplicacion de ambos metodos de analisis coinciden a grandes rasgos, lo que revela que esta nueva metodologia constituye una buena aproximacion y posible alternativa al analisis morfologico, aunque se necesitan mas estudios comparativos para adaptar bien esta tecnologia. So far, the study of the biological particles in the air we breathe has been mainly directed at knowing and controlling pollen and spores, aeroallergens with a well-known health impact., It has been recently suggested that the air is an ecosystem in itself, and that it probably has its own biota, which would be composed mainly of viruses, bacteria, fungal spores, and pollen. The main objective of the AIRBIOTA-CM project is to study this diverse set of biological particles present in the urban air in the Community of Madrid using a multidisciplinary, innovative and integrative approach. The project is collaboration between five research groups in very different fields, which aim is to get an overview on the composition and dynamics of biological particles in the air to optimize the methods of sampling and analysis. As a methodological innovation, there is an attempt to apply the breakthroughs in metagenomics to the study of bioaerosols. In addition, new collection strategies have been used, such as the use of unmanned aerial vehicles by designing or adapting new samplers for these vehicles, to sample at different altitudes and in urban geographic locations that might presumably have a different composition of the biota and relevant human activity. The project started in autumn 2014. The preliminary results presented here refer to the comparison of results obtained by means of traditional (light microscopy) and metagenomics methods on atmospheric pollen in the Community of Madrid. The data obtained by both analyses coincide broadly, revealing that the molecular methodology is a good and possible alternative approach to morphological analysis, although more comparative studies to adapt well this technology are needed.
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