Introduction à la bio-informatique structurale ; applications à deux cofacteurs de la coagulation, le facteur V et le facteur VIII

Les methodes bio-informatiques permettent de predire la structure tridimensionnelle (3 D) des proteines, certaines fonctions moleculaires et facilitent la conception de nouveaux medicaments. Ces outils informatiques s'utilisent aussi pour etudier l'ADN/ARN, les polysaccharides, les phospholipides et autres molecules. De surcroit, ce type d'approche theorique assiste tout design experimental visant a elucider les relations structure-activite et contribue aussi a l'examen critique des resultats. La coagulation sanguine implique la formation de nombreux complexes macromoleculaires. Ces reactions successives reposent essentiellement sur des interactions de type proteine/proteine et proteine/membrane dont la nature au niveau atomique echappe encore a notre comprehension. Cet article aborde les principales methodes bio-informatiques utilisees pour la prediction structurale et fonctionnelle des proteines. Differents exemples d'applications au systeme de la coagulation sont presentes et concernent plus particulierement le facteur V et le facteur VIII.