"The Clever machine"- a computational tool for dataset exploration and prediction

El proposito de mis estudios doctorales era desarrollar un algoritmo para el analisis a gran escala de conjuntos de datos de proteinas. Esta tesis describe la metodologia, el trabajo tecnico desarrollado y los casos biologicos envueltos en la creacion del algoritmo principal –el cleverMachine (CM) y sus extensiones multiCleverMachine (mCM) y cleverGO. El CM y mCM permiten la caracterizacion y clasificacion de grupos de proteinas basados en caracteristicas fisico-quimicas, junto con la abundancia de proteinas y la anotacion de ontologia de genes, para asi elaborar una exploracion de datos correcta. Mi metodo esta compuesto por cientificos tanto computacionales como experimentales con una interfaz amplia, facil de usar para un monitoreo y clasificacion de secuencia de proteinas de alto rendimiento.