Combinação de abordagens de análises de novo e guiadas pelo genoma para explorar dados de RNA-Seq de sementes oleaginosas para anotação de vias de ácidos graxos.

Elaeis guineensis (dende), Jatropha curcas (pinhao-manso) e Ricinus communis (mamona) produzem acidos graxos que podem ser utilizados como fonte renovavel na matriz energetica, apresentando um grande potencial biotecnologico para as industrias da area. O objetivo deste trabalho foi identificar transcritos relacionados com a sintese de acidos graxos e inferir a sua presenca em vias metabolicas. Para isso, o RNA total de sementes destas tres especies foi extraido e sequenciado. Os transcritomas foram montados utilizando abordagens de novo e guiados pelo genoma e filtrados com o programa Evidential Gene para a obtencao de resultados robustos. Uma base de dados contendo 527 sequencias de 170 codigos de enzimas unicos de 12 vias de metabolismo de acidos graxos foi gerada. Um total de 152, 156 e 150 transcritos de E. guineensis, J. curcas e R. communis referentes as proteinas pertencentes a 12 vias de metabolismo de acidos graxos foram encontradas respectivamente, sendo 135 em comum. Os resultados ainda sugerem que ha proteinas com expressao tecido-especificos pois 23, 6 e 11 proteinas de interesse de E. guineensis, J. curcas e R. communis nao foram encontradas nos transcritomas, respectivamente. A estrategia desenvolvida neste trabalho mostrou ser eficiente para a mineracao de dados de interesse em dados de RNA-Seq com baixa cobertura pois o uso de diferentes programas de montagem potencializou a identificacao das proteinas.