海蜇(Rhopilema esculentum)Notch基因的cDNA克隆和表达

基于转录组454 GS FLX测序结果，利用RACE和RT-PCR技术克隆了海蜇( Rhopilema esculentum ) Notch基因的cDNA全长，并分析了其mRNA在海蜇不同发育阶段的表达差异，以探讨Notch基因对海蜇无性生殖的影响。结果显示，海蜇Notch基因的cDNA全长为6768 bp，包括90 bp的5 非编码区、6066 bp的开放阅读框及612 bp包含AATAAA加尾信号的3 非翻译区。SMART分析表明，海蜇Notch为分泌蛋白，其信号肽由21个氨基酸组成。成熟肽由2000个氨基酸组成，包括37个结构域、26个表皮生长因子样结构域、3个富含半胱氨酸的Notch/Lin-12(NL)结构域、1个NOD结构域、1个NODP结构域、1个跨膜结构域和6个锚蛋白结构域ANK，并含有25个N-糖基化位点。同源分析表明，海蜇Notch与来自刺胞动物门的海葵( Nematostella