云南HPV-16型E6、E7基因的突变分析

人乳头瘤病毒（Human papillomavirus,HPV）16型（HPV-16）是引起宫颈癌的一种主要高危型病毒,其2个致癌基因E6和E7的核酸序列变异可能会影响其对宿主细胞的致癌性,已有研究表明其序列突变呈现地域差异性。因此,研究不同地域HPV-16这2个基因的变化情况是宫颈癌流行病学调研的主要内容,也可为研究E6和E7的致癌性积累数据。研究以NCBI登录号为NC001526.2的HPV-16型病毒的序列为参照,采用Neighbor-joining方法对云南地区74例HPV-16样本的E6、E7的DNA序列构建进化树,结果显示：只有亚洲和欧洲变异亚型,而没有发现非洲1、非洲2、亚-美洲和北美洲这4种变异亚型。DNA序列分析显示：E6的碱基突变以T178G（D25E,59.46%）和T350G（L83V,8.11%）为主,E7的碱基突变主要以A647G（N29S,59.46%）和T846C（同义突变,60.81%）为主。发现E6的新突变有A95G（同义突变,1.35%）和A135G（K11R,1.35%）;E7的新突变有C625T（L22F,1.35%）、C627T（同义突变,12.16%）、G689A（G43E,1.35%）、T748G（S63A,1.35%）。此外还发现有一个共突变现象：T178G（D25E,59.46%）-A647G（N29S,59.46%）-T843C（同义突变,21.62%）-T846C（同义突变,60.81%）。