谷子 TCP 基因家族成员序列特征及表达模式分析

2020 
为深入解析谷子 TCP 基因家族的功能,通过生物信息学方法对谷子 TCP 转录因子家族基因成员序列特征、基因结构、染色体定位、系统进化关系及表达模式进行分析。结果表明:除第 8 染色体之外,从谷子基因组上其余 8 条染色体中共鉴定出 26 个 TCP 家族成员,并根据其在染色体的顺序和位置先后进行命名,其中分布在第 3 和第 5 染色体上的 TCP 家族成员数量最多,高达 5 个。不同家族成员其编码的氨基酸残基数目具有明显差异,范围为 95 aa~451 aa 。其中 SiTCP21 基因编码氨基酸残基数目最少为 95 个氨基酸;而 SiTCP15 最多为 451 个氨基酸残基。 26 个 TCP 家族成员的蛋白结构中均含有 bHLH 保守结构域。基因表达分析结果表明, 31% 的成员在穗中的表达量明显高于其他组织,因此推测该基因家族可能对谷子穗部生长发育的调控起关键作用。本研究对深入研究 SiTCPs 家族基因的功能奠定了基础,也为谷子生长发育的调控机制提供了新的思路。
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