Otimização de protocolos para detecção molecular de viroses em inhame
2017
A presenca de sintomas de viroses e frequente nos plantios de inhame do Nordeste e constitui-se um dos fatores limitantes de producao. Ja foram relatados na cultura virus dos generos Potyvirus , Badnavirus , Potexvirus , Maculavirus , Comovirus e Cucumovirus . Destacam-se pela importância e distribuicao geografica, especies dos generos Potyvirus e Badnavirus. O objetivo deste trabalho foi otimizar e tornar reprodutivel protocolos para a deteccao molecular de especies dos generos Potyvirus e Badnavirus em inhame. Foram coletadas tuberas de 40 plantas com e sem sintomas de viroses nos municipios de Sao Felipe, Maragojipe, Sao Felix e Cruz das Almas. Para a deteccao de Badnavirus o DNA total foi extraido com base no protocolo de Kamal Sharma (2009) com modificacoes na quantidade de material vegetal processado, nas centrifugacoes, na concentracao do DNA e na temperatura de anelamento na PCR. Enquanto para Potyvirus ( Yam mosaic virus, YMV e Yam mild mosaic virus ,YMMV), o RNA foi extraido testando as seguintes metodologias: Kit de Extracao de RNA Total Axygen, Easyzol e protocolo de Gambino (2008), com modificacoes semelhantes as avaliadas no protocolo de extracao de DNA. Para Badnavirus detectou-se uma banda de 580 pares de bases (pb). Na deteccao de Potyvirus , obteve-se um fragmento de 586 pb com os primers para o YMV. O YMMV nao foi detectado em nenhuma das amostras analisadas. Contudo, os protocolos que apresentaram melhores respostas para extracao de DNA e RNA foram Kamal Sharma (2009) e Gambino (2008), respectivamente. Os fragmentos genomicos obtidos foram sequenciados, apresentando alta homologia com Badnavirus e YMV.
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