我国羊巴贝斯虫 trap 基因结构及遗传进化分析

本研究拟解析我国羊巴贝斯虫 trap 基因的结构特征，并以其为分子标志开展遗传进化分析，为理清我国羊巴贝斯虫的分类关系提供数据。用公布的巴贝斯虫 trap 基因序列BLAST两个羊巴贝斯虫全基因组本地数据库，以获得的保守序列片段为模板，设计PCR引物；克隆我国分离的6株羊巴贝斯虫 trap 基因全长序列，分析其序列结构特征；比对序列相似性，构建系统发生树，分析其遗传进化关系。结果克隆获得6株羊巴贝斯虫 trap 基因，分析结果显示，其具有3、4、5个内含子的三种内含子数目，预测的开放阅读框（ORF）大小分别为1 944、2 100/2 142和2 286 bp；氨基酸序列分析显示，其都具有TRAP蛋白家族特征性的vWFA、TSR、跨膜域和CTD结构域；进化关系分析显示，感染我国羊的巴贝斯虫被分成3组，组内序列相似性为99.8%~100%，而组间为43.6%~74.6%。系统发生树上6株羊巴贝斯虫被分到两大枝，羊巴贝斯虫未定种和莫氏巴贝斯虫，而且莫氏巴贝斯虫又被分成两小枝。6株羊巴贝斯虫 trap 基因结构存在差异，但其蛋白特征性的结构域较为保守；我国分离的羊巴贝斯虫为两个种，但莫氏巴贝斯虫中可能存在两个亚种。