Gestion et valorisation des carottes sédimentaires à but scientifique en France : vers un système intégré

Les carottes sedimentaires font l'objet d'un interet grandissant de la part des paleo-environnementalistes mais egalement d’ecologues qui s'interessent a la trajectoire des ecosystemes (Pansu et al., 2015; Perga et al., 2015). Les carottes marines ou continentales prelevees dans le cadre de consortiums internationaux (IODP, ICDP) donnent l’exemple depuis des decennies en terme de partage d’echantillons pour ce type d’etude ; plus recemment l’augmentation de re-etudes massives de donnees publiees (Bolliet et al., 2016; Cartapan is et al., 2016) demontrent la valeur de ces echantillons et des donnees associees. De leur cote depuis quelques annees, les legislateurs et financeurs poussent a l’ouverture, au partage et a la tracabilite des donnees : on peut citer l’OCDE, l’UE, l’ERC... Comment notre communaute peut-elle s’inscrire au quotidien dans ces processus qui demandent de profonds changements culturels dans nos pratiques de recherche ? C’est pour tenter d’apporter une reponse a cette question que nous avons cherche a developper un systeme integre de captation et de gestion des metadonnees des echantillons issus de forages scientifiques, qui puisse etre implemente au niveau national et connecte a des initiatives internationales, sur lequel pourront venir s’appuyer les futurs Plans de Gestion de Donnees. Par une approche bottom-up, pragmatique et au plus pres des pratiques des equipes de recherche, nombreuses, dispersees, aux moyens inegaux, et en s’appuyant sur des initiatives existantes, nous tentons de repondre petit a petit a differents niveaux - de la mission de prelevement jusqu'a leur stockage, en passant par la mise a disposition, le suivi et la valorisation des echantillons et des metadonnees qui leur sont associees. Des avancees rapides ont pu etre obtenues par la rencontre entre une communaute de paleoecologues et des equipes techniques novatrices dans le domaine du partage et de l’interoperabilite melant des informaticiens, geomaticiens, curateurs d’echantillons et de donnees. Cette dynamique s’appuie sur 3 projets nationaux (Cyber-Carotheque nationale s/c Equipex CLIMCOR ANR-11-EQPX-0009 ; QR-Code LTSER- France ; ROZA LTSER-France) et s’inscrit dans le cadre du Centre de Carottage et de Forage National (C2FN), une cellule de la division technique de l’INSU. Nous presenterons dans cette intervention 4 outils qui seront a court terme interconnectes : i)CoreBOOK, une application mobile de terrain dediee a la captation des metadonnees de forage ; ii) le portail de la cyber-carotheque national, un hub accueillant les donnees nouvellement acquises et les inventaires de carotheques ; iii) Collec-Science, outil generique de gestion de collections d’echantillons naturels adapte a nos besoins (s/c projet QrCODE); enfin iv) ROZA (Retro-Observatoire des Zones Ateliers), un prototype de decouvreur et visualiseur de donnees destine a favoriser la reutilisation des echantillons et des donnees paleoenvironnementales en mettant a disposition les donnees essentielles a la capitalisation des connaissances d’etudes successives sur un meme site. Les perspectives aujourd'hui sont grandes, le systeme modulaire qui commence a se dessiner doit permettre a chacun de trouver son compte, a son rythme, ou operationnel peut enfin rimer avec standardisation, tracabilite et interoperabilite tout en conservant une utilisabilite au plus proche des activites et besoins quotidiens des chercheurs et personnels d’accompagnement, afin d’operer un virage en douceur vers des pratiques de la science dite « ouverte "