Procédés d'identification d'une liaison génétique

La presente invention concerne un systeme a haut debit pour determiner la liaison de polynucleotides distincts et determiner la sequence des polynucleotides qui sont lies aux polynucleotides distincts. Ces procedes sont particulierement utiles pour analyser des transgenes dans un organisme hote transforme. Les procedes decrits permettent la detection d'une liaison entre des polynucleotides transgeniques distincts dans des hotes transformes et le sequencage de regions d'ADN liees aux polynucleotides transgeniques distincts. L'invention concerne egalement des procedes d'identification d'une plante transgenique contenant une insertion de transgene dans un site genomique indesirable.