Víztakarékos öntözéstechnikával termeszthető rizsfajtákra jellemző génexpressziós mintázatok = Gene expression profiles characteristic to rice varieties cultivated under water-saver irrigation regime

2008 
Elterő vizigenyű rizsfajtak (''szarazrizsek'' es hagyomanyos fajtak) novekedesi, termesztesi parametereit hataroztuk meg arasztasos ill csak kiegeszitő ontozeses korulmenyek kozott annak erdekeben, hogy a korlatozott vizellatashoz jol adaptalodo fajtakra jellemző tulajdonsagokat megallapithassuk. Kidolgoztunk egy olyan kiserleti rendszert, melyben ezeknek a fajtaknak a gyokernovekedeset vizsgalhatjuk, illetve genexpresszios vizsgalatokhoz mintat gyűjthetunk. Transzkript profilok microarray hibridizacios felvetelevel megallapitottuk, hogy a melyrehatolo, erőteljes gyokerzet meghatarozo jellemzője a szaraz korulmenyek kozott is jol teljesitő fajtaknak, es tobb szaz olyan gent talaltunk, melynek transzkript-szintje vizellatastol fuggő napszakos valtozasokat mutat a legnagyobb tűrőkepessegű Sandora fajta gyokerzeteben. Valosidejű kvantitativ PCR-rel ellenőriztuk szamos gen expresszios mintazatat, ez dontő tobbsegeben megerősitette a microarray hibridizacioval kapottakat, egyuttal mas aszalyerzekenysegű rizsfajtakban is meghataroztuk ezen genek expresszios mintazatat. | Rice cultivars featuring different water demand (upland and traditional cultivars) were studied in this project. Growth and harvest parameters of these cultivars were determined under flooding and limited sprinkle irrigation in order to find features characteristic to genotypes adapting well to water limitation. An experimental system was established that allows studies of root growth as well as collection of samples for gene expression experiments. Microarray hybridizations revealed the transcript profile of Sandora cultivar that develops strong and deep root system which is an important component of good yield performance under drought stress. Several hundred genes were found which showed water supply dependent transcript level changes in the roots of this cultivar on a daily manner. Microarray results were confirmed by quantitative real-time PCR for several genes. The expression patterns of these genes were also checked in cultivars being less drought tolerant.
    • Correction
    • Source
    • Cite
    • Save
    • Machine Reading By IdeaReader
    0
    References
    0
    Citations
    NaN
    KQI
    []