IDENTIFICAÇÃO, CARACTERIZAÇÃO E ANÁLISE FILOGENÉTICA DA FAMÍLIA DE PROTEÍNAS GILP EM PLANTAS

Os vegetais desenvolveram mecanismos de resposta contra danos e doencas que, quando acionados, reconhecem e combatem o dano. Um desses mecanismos envolvidos na percepcao da planta ao estabelecimento de estresses e conhecido como morte celular programada (MCP). Em soja e Arabidopsis thaliana L., genes pertencentes a familia genica LSD (do ingles lesion simulating disease) apresentam sua expressao modulada em plantas submetidas a condicoes de estresse, demonstrando o envolvimento dessa familia em processos relacionados a regulacao da MCP. Comprovou-se tambem a interacao fisica entre a proteina LSD1 e a proteina Gilp (do ingles GSH-induced LITAF domain) de A.thaliana. Ate o momento, em plantas, proteinas Gilp vem sendo muito pouco exploradas. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi combinar estrategias de bioinformatica para contribuir com o conhecimento do papel da familia de proteinas Gilp na resposta as condicoes de estresse em plantas. A sequencia codificante da poteina Gilp presente em A.thaliana foi utilizada como isca para buscas usando a ferramenta BLAST, realizadas contra 42 especies de plantas do banco de dados Phytozome (http://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html). Ao todo foram identificados 39 genes Gilp. Para avaliar o nivel de conservacao dos dominios dos genes identificados, utilizou-se o software MEME (http://meme-suite.org). Buscou-se em outras plataformas como Target P (http://www.cbs.dtu.dk/services/TargetP) e WOLF (http://www.gscript.com/psort/wolf_psort.html), a predicao da localizacao subcelular dessas proteinas, e dominios transmembranas nessas sequencias, atraves dos programas TMHMM (http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM) e TMPred (http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html). Todos os genes encontrados foram alinhados no programa MEGA (http://www.megasoftware.net), e a arvore filogenetica foi inferida atraves do metodo de analise Bayesiana utilizando o software BEAST (http://beast.bio.ed.ac.uk). Algumas proteinas foram utilizadas para modelagem 3D, utilizando a plataforma SwissModel (http://swissmodel.expasy.org). A elucidacao do papel desempenhado pelas proteinas Gilp frente as condicoes de estresse podera contribuir para esclarecer a intrincada rede de sinalizacao ativada em condicoes de estresses, permitindo, inclusive, o delineamento de estrategias de melhoramento genetico ou que visem o aumento da produtividade agricola.