Construction d'un SPIM pour l'observation 3D in-vivo des déformations de la coiffe racinaire

2018 
Le developpement du systeme racinaire resulte de l’equilibre entre les interactions physiques et chimiques avec le sol et la perception de conditions environnementales plus globales comme, par exemple, la gravite terrestre qui permet a la racine de percevoir la verticale. La morphogenese du systeme racinaire est en particulier conditionnee par l’apex racinaire qui oriente la croissance longitudinale des racines. L’apex racinaire est connu pour etre une zone influencee par les proprietes chimiques et mecaniques de son environnement. Cependant, la rheologie de l’apex racinaire (lien entre ses deformations et les contraintes auxquelles il est soumis) lors de la progression des racines demeure mal connue. Etudier cette rheologie necessite l’observation de la deformation a l’echelle cellulaire de l’apex racinaire dans des conditions in-vivo au sein de milieux aux proprietes mecaniques mesurables et controlables. Pour ce faire nous avons developpe un microscope a feuillet de lumiere (SPIM : Selective Plane Illumination Microscopy) en nous appuyant sur le projet OpenSPIM qui propose des plans sous licence libre pour sa construction. Cette technique d’imagerie par fluorescence connait un gain d’interet depuis une dizaine d’annees du fait de ses capacites d’imagerie 3D in-vivo permises par une vitesse d’acquisition rapide accompagnee d’une faible phototoxicite. Nous presenterons ici cette technique de microscopie, la construction de cet instrument et ce qu’il apporte pour l’etude de la croissance des racines in-vivo.
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