ÁRBOLES DE EXPANSIÓN MÍNIMOS: AYUDAS PARA UNA MEJOR INTERPRETACIÓN DE ORDENACIONES EN BANCOS DE GERMOPLASMA

2005 
En colecciones de germoplasma, el material genetico de interes es caracterizado a traves de multiples descriptores (variables). Cada accesion de la coleccion es representada por un vector de datos que pertenece a un espacio multidimensional. Las configuraciones multidimensionales son dificiles de interpretar al no ser facilmente visualizadas. Un objetivo del analisis de matrices de datos de accesiones×descriptores es el ordenamiento del material genetico en un espacio bi-dimensional, el cual comunmente es optimo por representar la maxima variabilidad. Metodos de analisis vectorial, como el Analisis de Componentes Principales (ACP), permiten reducir la dimension bajo ese criterio de optimalidad. Los resultados del ACP se visualizan representando las accesiones a ordenar como puntos de un grafico de dispersion segun el valor que estas asumen sobre los dos ejes principales (de mayor varianza) de ordenacion. Por la perdida de informacion al ordenar en un espacio de dos dimensiones, las distancias en el plano suelen no ser las distancias en el espacio original, conduciendo a errores de interpretacion de relaciones entre accesiones. En este trabajo se cuantifica el error de interpretacion en las relaciones inferidas del plano generado por los dos primeros componentes principales (CP), bajo escenarios simulados que involucran distintos tamanos de colecciones de germoplasma para un rango amplio de variabilidad explicada por los dos primeros CP (medida indirecta de la calidad de la representacion). Los resultados sugieren que aunque estos componentes expliquen >70% de la variabilidad total mayor, el error de interpretacion es estadisticamente >0 y depende del numero de objetos ordenados. Los Arboles de Expansion Minimos, como complemento de ordenaciones producidas por analisis vectoriales, representan una herramienta eficiente para entender mejor las ordenaciones. Se ilustra la utilizacion de esta tecnica en la interpretacion de las ordenaciones producidas a partir del ACP
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