Isolamento, caracterização e mapeamento físico do elemento retrotransponível non-LTR REX3 no cariótipo de populações de Ancistrus da bacia do Rio Paraná

2018 
Transposons e retrotransposons (ETs) representam uma grande porcao do genoma eucariotico e diferentes linhas de evidencia reportam uma massiva presenca dessas sequencias no genoma de peixes. Atribui-se a esses elementos um significativo papel para a evolucao dos genomas e na diversificacao cariotipica em eucariotos. O genero Ancistrus e um interessante candidato as investigacoes dessa natureza, visto que extensa variacao cromossomica tem sido reportada. Visando a compreensao da distribuicao e comportamento do elemento retrotransponivel Rex 3 no genero Ancistrus e melhor entendimento da organizacao genomica nesses representantes, o presente estudo objetivou isolar, caracterizar e mapear cromossomicamente o ET Rex 3 no genoma de diferentes populacoes de Ancistrus sp. coletados em diversos rios da bacia do rio Parana, no estado do Parana. O ET foi isolado atraves da amplificacao com os primers para Rex 3 e revelou resultado positivo gerando fragmentos de aproximadamente 500 pb para as dez populacoes analisadas. Experimentos de hibridacao in situ fluorescente foram realizados em 6 populacoes utilizando como sonda o ET Rex 3 isolado de uma especime de Ancistrus sp. do rio Keller. O mapeamento fisico revelou sinais fluorescentes dispersos pelos cromossomos de todas as populacoes de Ancistrus analisadas, sendo observados clusters desse elemento em alguns pares cromossomicos associados com blocos de heterocromatina previamente detectados. Nao foram observados sinais de hibridacao acumulados nos cromossomos sexuais heteromorficos (XX/XY) das populacoes de Ancistrus sp. rio Keller e Corrego 19. A analise das sequencias nucleotidicas das copias isoladas do genoma das populacoes de Ancistrus revelaram alta similaridade com sequencias desse mesmo elemento depositadas no banco de dados online CENSOR. O alinhamento da sequencia de aminoacidos presumida com Xiphophorus maculatus revelaram dominios da transcriptase reversa altamente conservados e integros, o que sugere que esse elemento e potencialmente ativo nesse genoma e pode ter contribuido no espalhamento das copias detectadas por FISH. As populacoes de Ancistrus apresentam grande variacao quanto ao padrao de heterocromatina e a presenca de ETs Rex 3 em alguns dos blocos sugerem sua participacao na dispersao dos mesmos. Nossos dados permitem a formulacao de hipoteses sobre os mecanismos de diversificacao cariotipica no genero Ancistrus, envolvendo efetivamente esses elementos.
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