栀子及其近缘茜草科植物、混伪品的rDNA-ITS2序列分析

目的：利用r DNA-内转录间隔区2（internal transcribed spacer 2,ITS2）序列对栀子及其近缘茜草科植物、混伪品进行快速鉴定。方法：对研究材料ITS2片段进行聚合酶链式反应（PCR）扩增并双向测序,所得序列经Codon Code Aligner拼接后,序列变异位点采用PAUP 4.0b10进行统计分析,利用MEGA 5.0软件进行数据分析,并构建邻接（NJ）树,再利用已建立的ITS2数据库及其网站预测ITS2二级结构。结果：对栀子及其近缘茜草科植物、混伪品ITS2序列长度为201～235 bp,系统发育树上显示不同来源的样本根据亲缘关系的远近各聚一支,表现出单系性;而同时又与混伪品明显分开。比较ITS2二级结构发现,栀子及其近缘茜草科植物、混伪品在4个螺旋区的茎环数目、大小、位置以及螺旋发出时的角度均有明显差异。结论：r DNAITS2可以方便快捷地鉴定栀子及其近缘茜草科植物、混伪品。