Identification de gènes impliqués dans le contrôle des fonctions digestives chez le poulet de chair

La durabilite de l’elevage avicole passe par la recherche de systemes de production plus economes et autonomes en termes d’approvisionnement en matieres premieres pour l’alimentation animale. Ceci implique une meilleure prise en compte des caracteres d’adaptation tels que l’efficacite digestive afin d’aller vers une plus forte utilisation de matieres premieres alternatives de qualite variable. L'objectif du projet ADIGEN etait d’identifier des genes impliques dans la digestion en caracterisant le transcriptome de differents compartiments du tube digestif : la jonction entre proventricule et gesier, le gesier, la jonction gastro-duodenale, et le jejunum. Les ARNs totaux des 4 tissus ont ete sequences sur HiSeq2500 (plateforme GeT-PlaGe, Toulouse) pour 6 individus issus d’un croisement F2 entre 2 lignees divergentes pour leur efficacite digestive (D+/D-). Les analyses bioinformatiques et biostatistiques des donnees RNA-seq ont mis en evidence un total de 11216 transcrits exprimes differentiellement entre les 4 tissus. Au total, 8 groupes de genes presentant des profils d'expression tres differents ont ete identifies. L'analyse fonctionnelle par « Gene Ontology » des classes de genes montre un enrichissement significatif de la fonction immunitaire dans le jejunum, et de l'activite transcriptionnelle et traductionnelle dans le gesier et le pylore. Cette analyse nous permet de dresser un premier portrait moleculaire des differents compartiments du tractus digestif, qui servira de base pour les futures etudes sur le controle genetique ou physiologique de la reponse de l’animal aux variations alimentaires.