Genômica funcional de fungos micoparasitas

A revolucao da genomica tem mudado o paradigma para a analise dos processos e sistemas biologicos. Atualmente, esses processos e sistemas podem ser descritos baseados na comparacao global e quantitativa dos padroes de expressao genica de celulas e tecidos, representando diferentes situacoes experimentais. Uma variedade de tecnicas inovadoras tem sido desenvolvida nesse sentido para analisar a expressao genica ao nivel de mRNA (transcriptoma). Tais metodos incluem microarrays (SCHENA et al., 1995), differential display (LIANG e PARDEE, 1992), SAGE (VELCULESCU et al., 1995), cDNA AFLP (BACHEM et al., 1996), TOGA (SUTCLIFFE et al., 2000) e GC (SHIMKETS et al., 1999). No entanto, a descoberta de mecanismos pos-transcricionais que controlam a taxa de sintese e a meia-vida das proteinas (VARSHAVSKY, 1996) e a ausencia de uma correlacao preditiva entre os niveis de proteinas e seus mRNAs correspondentes (FUTCHER et al., 1999; GYGI et al., 1999) indicam que a analise do conteudo total de proteinas (proteoma) tambem e necessaria. Nesse sentido, a proteomica surge como uma importante ferramenta para a analise funcional dos genomas, com o potencial de acelerar a previsao da funcao de genes desconhecidos. A proteomica pode ser definida como a analise global da expressao genica ao nivel de proteina, e o metodo padrao de analise combina a separacao de proteinas em gel de eletroforese bi-dimensional (2-DE) com a identificacao das proteinas selecionadas por espectrometria de massa. A presente linha de pesquisa, desenvolvida no Laboratorio de Estudos em Meio Ambiente – LEMA da Universidade Catolica do Salvador – UCSal, consiste na analise funcional de genomas de fungos micoparasitas, com enfase em proteomica, visando um melhor entendimento do mecanismo biologico envolvido no processo de micoparasitismo de fungos fitopatogenicos. O projeto que vem sendo desenvolvido atualmente nesta linha de pesquisa e o “Projeto Proteoma de Trichoderma stromaticum: identificacao, caracterizacao e analise funcional de proteinas envolvidas no controle biologico do patogeno de cacau Crinipellis perniciosa”. O presente projeto investiga o proteoma de Trichoderma stromaticum, que tem sido considerado como um dos agentes de controle biologico de maior potencial no combate a vassoura-de-bruxa do cacaueiro, causada por Crinipellis perniciosa. Essa investigacao permitira o isolamento das proteinas e dos genes relacionados ao processo de micoparasitismo e, em acoes de pesquisas posteriores e com base nos dados a serem gerados neste projeto, estabelecer-se-a alternativas consistentes e instrumentos eficazes para o controle economica e ecologicamente sustentavel de C. perniciosa. O projeto conta com a participacao de diferentes instituicoes colaboradoras, como UnB, UESC, EMBRAPA/CENARGEN e Almirante Cacau/M&M Mars.