玻璃质壳类底栖有孔虫卷转虫属Ammonia spp.的DNA保存方式和提取效能比较研究

对有孔虫的DNA进行有效保存及提取是开展有孔虫分子鉴定工作的前提。本研究以探索适合玻璃质壳类底栖有孔虫的DNA保存及提取方法为目的, 以中国近海优势属——玻璃质类底栖有孔虫卷转虫属( Ammonia spp.)为模式生物, 考察不同温度(20-120℃, 间隔10℃)烘干、冷冻(-20℃、-80℃, 有水、无水)以及脱氧胆酸钠裂解液(Na deoxycholate, 简称DOC)处理(含和不含EDTA)保存有孔虫DNA方法, 同时进行了DOC裂解液法和Guanidine裂解液法对 Ammonia spp. DNA提取效能的比较。结果显示, 烘干保存法中20℃组和30℃组显著优于40℃组( P P P >0.05)。三种保存方法综合效果表现为冷冻组显著优于烘干组和裂解液组( P <0.05); 两种DNA提取方法的提取效果都很好, 但DOC法更廉价且操作简便。本文给出了一套适用于玻璃质壳类有孔虫的DNA保存和提取的优化方案。