Molecular recognition of a cyclophane as a receptor towards arginine methyl ester: theoretical perspectives

En este estudio nos enfocamos en el reconocimiento molecular de arginina con un ciclofano como receptor. Este macrociclo consiste de dos unidades fenileno-0-fenileno unidas por dos cadenas EDTA y contiene cuatro grupos carboxilato pendientes. Para entender las interacciones de estos sistemas realizamos una busqueda conformacional y optimizaciones geometricas con el uso de la Teoria del Funcional de la Densidad (DFT). Decidimos enfocarnos en dos diferentes escenarios. En el primero, la arginina metilester y el ciclofano no estan cargados. En el segundo, ambas especies son ionicas y el sistema globalmente es neutral. Los calculos revelan que de hecho interactuan favorablemente, donde la configuracion mas estable es aquella en la cual la arginina metilester cationica se extiende sobre el ciclo e interactua con los grupos carboxilato desprotonados.