DESENVOLVIMENTO DE MARCADORES ASSOCIADOS À RESISTÊNCIA AO BICHO-MINEIRO: SELEÇÃO E VALIDAÇÃO DE SNPs

O objetivo deste estudo e o desenvolvimento de marcadores do tipo SNPs associados com a resistencia ao bicho-mineiro em cafe. A estrategia principal utilizou as analises genomicas de microarranjo, para caracterizacao de expressao diferencial de genes-candidatos em plantas resistentes infestadas com o bicho-mineiro. Inicialmente, analises in silico de 2137 destes genes identificaram aqueles potencialmente relacionados com a especificidade da resposta de defesa da planta. Uma vez selecionados, o perfil de expressao de 22 genes foi confirmado por qRT-PCR em experimentos utilizando plantas resistentes e suscetiveis, infectadas pelo bicho-mineiro. Para busca de polimorfismos do tipo SNPs, que poderao ser utilizados como marcadores para selecao-assistida, selecionamos 4 genes, cujas regioes genomicas foram clonadas e sequenciadas em genotipos parentais da populacao em estudo. Apos analises in silico de sequencias genomicas, os polimorfismos do tipo SNPs identificados serviram de base para construcao de sondas alelo-especificas, utilizadas na genotipagem de plantas parentais e progenies em selecao. A analise de segregacao de SNPs identificados indicou que nenhum dos polimorfismos avaliados apresenta correlacao com a caracteristica de resistencia ao bicho-mineiro. Estes polimorfismos estao associados com alguma outra caracteristica agronomica nao avaliada neste estudo. A genotipagem de outros SNPs identificados esta em andamento.