基于PCR/LDR技术的水稻香味等位基因 Badh2-E2 功能性分子标记

水稻中水稻甜菜碱醛脱氢酶(BADH2)功能缺失导致其酶促反应的底物2-乙酰-1-吡咯啉(2AP)的累积，使得稻米产生香味。水稻香味等位基因 badh2-E2 在我国的香稻育种中有较广泛的应用。本研究根据 badh2-E2 香味等位基因在第二外显子处7 bp缺失，设计了一个基于PCR/LDR技术的功能性分子标记。利用PCR/LDR标记对申繁24、申繁26，及其杂交 F1 代的基因型进行鉴定，可以准确的鉴定出 badh2-E2 位点的基因型。用PCR/LDR标记对杂交F2代群体的基因型进行鉴定，发现 badh2-E2 阳性纯合型、杂合型和 badh2-E2 阴性纯合型这3种基因型符合1：2：1分离比。本研究的结果为标记辅助育种提供了一种新的标记类型，具有一定的应用价值。