海蜇( Rhopilema esculentum )磷脂酶A 2 基因的cDNA、基因组克隆与表达分析

2016 
本研究利用RACE和RT-PCR技术克隆了海蜇( Rhopilema esculentum )磷脂酶A 2 基因(Re-PLA 2 -1)的cDNA及基因组序列,并分析了其mRNA在海蜇不同发育阶段的表达。Re-PLA 2 -1基因的cDNA全长为824 bp,包括了48 bp的5'非编码区、504 bp的开放阅读框及272 bp的3'非翻译区。SMART 分析显示, Re-PLA 2 -1为分泌蛋白,包括了一个由19个氨基酸组成的信号肽和一个由118个氨基酸组成的磷脂酶A 2 结构域。多序列比对和系统进化分析显示,Re-PLA 2 -1基因与来自星状海葵( Nematostella vectensis )、僧袍芋螺( Conus magus )、长牡蛎( Crassostrea gigas )等磷脂酶A 2 的相似性较高,共同聚类为pfam09056 GIX PLA 2 分支,均包含pfam09056家族成员酶活性所必需的Ca 2+ 结合位点、活性催化位点和PLA 2 结构域所必需形成二硫键的半胱氨酸。Re-PLA 2 -1基因组全长为2671 bp,由4个外显子和3个内含子组成。RT-PCR结果显示, Re-PLA 2 -1基因在海蜇4个发育阶段均有表达, 其中, 横裂体阶段的表达量最高, 碟状体阶段最低。这些研究结果为进一步了解海蜇磷脂酶A 2 毒素的生物功能奠定了基础。
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