Diverged Copies of the Seed Regulatory Opaque-2 Gene by a Segmental Duplication in the Progenitor Genome of Rice, Sorghum, and Maize

全部染色体的顺序的比较分析显示出那基因复制， chromosomal 部分复制，或甚至整个的染色体复制(WGD ) 在许多真核细胞的种类的进化起了突出的作用。这里，我们在玉米使用了一个众所周知的抄写因素的古老的复制，由 Opaque-2 (O2 ) 地点编码了，检验 chromosomal 的分叉的一般特征以一种系特定的方式的部分复制。我们在米饭利用了连续 chromosomal 顺序信息(Oryza sativa， Nipponbare ) ，蜀黍(蜀黍二色， Btx623 ) ，并且玉米(Zea mays， B73 ) 那被保存基因顺序(synteny ) 排列。这分析证明玉米 O2 地点被包含在以内一 125 万基础对(Mb ) 在染色体 7 上分割，它 5600 万年以前被复制(mya ) 在米饭和玉米的裂口前 50 ? mya。尽管它与一样的 DNA 和蛋白质绑定性质把蛋白质编码为内乳，染色体 1 上的复制区域仅仅是半尺寸并且包含玉米 OHP 基因，它不恢复 o2 变化。部分复制是不仅在米饭，而且在蜀黍发现，它从玉米 11.9 切开了 ? mya。复制区域的详细分析包括删除，复制，变换，倒置，和 translocations 为复杂重新整理提供了例子。而且，米饭和蜀黍染色体看起来比玉米染色体更稳定，可能因为玉米经历了 allotetraploidization 然后 diploidization。