泥蚶( Tegillarca granosa )血细胞转录组序列中免疫相关基因的结构与mRNA表达量分析

贝类血细胞直接参与异物吞噬和包囊作用，还在伤口修复、炎症反应过程中发挥重要作用，是机体免疫防御的承担者。本研究采用RNA-seq测序技术研究了鳗弧菌感染前后泥蚶血细胞的转录组序列，通过序列组装，获得了α-葡萄糖苷酶（GAA）、α-甘露糖苷酶（LAMAN）、芳基硫酸酯酶B（ASB）、天冬酰胺氨基葡萄糖酶（AGA）、整合素β3亚基（ITB3）、热休克蛋白9（HSPA9）和Toll相互作用蛋白（TOLLIP）序列，利用Orffinder获得了其编码蛋白序列，并对蛋白序列进行了理化性质、二级结构、保守结构域和三级结构分析。结果表明：7种蛋白质二级结构均含有α螺旋、β折叠及无规则卷曲，泥蚶和人类ITB3和TOLLIP具有相同的保守结构域，Swiss-model同源建模获得的三级结构与模板同源性均超过35%（TOLLIP除外）。鳗弧菌刺激后，GAA、LAMAN、ASB、AGA和HSPA9的表达量显著增加，ITB3和TOLLIP表达量变化不明显。该研究补充和完善了对泥蚶免疫相关基因的认识，并为进一步开展泥蚶抗病机理研究提供了重要的理论依据。