乌拉尔图小麦(Triticum urartu)多药抗性基因 TuPDR7 的生物信息学分析

2019 
多药抗性基因 (pleiotropic drug resistance, PDR) 是 ATP-binding Cassette (ABC) 转运蛋白基因三大亚家族中的一个,具有对生物和非生物胁迫的广谱抗性。本研究以乌拉尔图小麦为材料,以小麦 TaPDR7 基因序列为探针,在乌拉尔图小麦的 DNA 、 CDS 和氨基酸序列数据库中搜索到同源序列,命名为 TuPDR7 ,并对其进行生物信息学分析。结果表明, TuPDR7 长 4 140 bp ,编码 1 379 个氨基酸,预测其蛋白分子量为 155.5 kD ,等电点为 6.1 ,是一个膜蛋白。同源序列比对和三级结构预测显示 TuPDR7 具有 PDR 基因典型的结构域。启动子预测表明 TuPDR7 含有对禾谷镰刀菌等真菌、脱氧雪腐镰刀菌烯醇 (DON) 、生物激素、盐胁迫、冷胁迫、干旱胁迫等的响应元件,说明其可能是一个广谱抗性基因,对于乌拉尔图小麦的抗性研究具有重要意义。
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