La lutte alternative contre les salmonella: Etudes des interactions entre des souches Libanaises de Salmonella et des souches de bactéteries lactiques

Les salmonelles d'origine alimentaire continuent de representer une menace majeure pour la sante publique, en particulier celles d'origine avicole. Ces dernieres annees, une tendance a la hausse de la resistance aux antimicrobiens (AMR) chez les salmonelles a ete remarque en raison de la mauvaise utilisation des antimicrobiens. Pour trouver des alternatives a ce probleme emergent, des probiotiques, en particulier Lactobacilli sp., ont ete proposes. Les donnees sur les salmonelles dans l’industrie avicole libanaise etant rares, cette etude a ete menee pour determiner la prevalence des salmonelles a differents stades de la chaine de production des poulets de chair et de poules pondeuses, l’antibioresistance et leurs profils moleculaires. En outre, l'activite probiotique de souches aviaires de Lactobacillus indigenes a ete testee contre les salmonelles. Le criblage de l'activite anti-salmonelle, de l'innocuite notamment de l'antibioresistance, et des proprietes probiotiques de surface des souches de lactobacilles a egalement ete effectue. Sur une periode de 3 ans, les echantillons de matieres fecales ont ete collectes par la methode de la pedichiffonnette dans des fermes libanaises locales (n = 237), tandis que la viande de volaille a ete collectee dans des abattoirs (n = 134) et sur le marche (n = 1907). En parallele, des echantillons de caeca (n = 115) et de peaux de cou (n = 115) ont ete collectees dans deux grands abattoirs. Les resultats ont mis en evidence une forte prevalence de Salmonella chez les volailles. En tenant compte de tous les echantillons, une grande diversite de serotypes a ete identifiee, avec une predominance de Salmonella Infantis (32,9%), Salmonella Enteritidis (28,4%) et Salmonella Kentucky (21,4%) avec une antibioresistance elevee dans tous les isolats de Salmonella. La resistance la plus importante a ete observee chez neuf souches de S. Kentucky resistantes a la ciprofloxacine (CIPR) et a la cephalosporine a spectre etendu (ESC). Ces souches ont ete genetiquement caracterisees par sequencage du genome entier (WGS). Les resultats ont montre, pour la premiere fois au Liban, un cas de detection et de dissemination du S. Kentucky ST198 hautement resistant. La methode PFGE a montre la presence d’un clone persistant de S. Enteritidis (80% des souches) commun entre les souches aviaires et humaines. Des profils genomiques ainsi que des phenotypes de resistance aux antimicrobiens similaires ont ete detectes entre les fermes, les abattoirs et le marche, suggerant la circulation et la transmission de clones identiques tout au long de la chaine alimentaire et des poules pondeuses Les resultats du criblage des probiotiques potentiels montrent que quatre especes de Lactobacillus ont ete identifiees : L. reuteri (n = 22, 44%), L. salivarius (n = 20, 40%), L. fermentum (n = 2, 4%) et L. crispatus (n = 1, 2%) et deux Enterococcus fecalis. Huit lactobacilles ont ete choisies en fonction de leur capacite d'hydrophobicite et de leur capacite d'auto/coagregation pour un test ulterieur d’adherence. L'attachement des souches de lactobacilles variait de 0,53 a 10,78%. L. salivarius A30 / i26 et 16 / c6 et L. reuteri 1 / c24 presentant la capacite d'adherence la plus elevee ont ete evaluees pour leur capacite a rivaliser et a exclure l'agent pathogene du site d'adhesion sur la lignee cellulaire caco-2. Il a ete demontre que L. salivarius 16 / c6 excluait fortement l’adhesion des trois serotypes de Salmonella a des niveaux significatifs.