Caractérisation du contenu génique de petits chromosomes marqueurs surnuméraires par analyse chromosomique sur puce à ADN chez des patients infertiles

L’observation de petits chromosomes marqueurs surnumeraires (sSMC) sur le caryotype est plus frequente lors d’une infertilite que dans la population generale (0,125 % vs 0,043 %) [1] . La survenue d’une infertilite peut etre due a une perturbation de la meiose [2] mais aussi potentiellement a une amplification de certains genes. Neanmoins, bien que 30 % des sSMC soient associes a un desequilibre de l’euchromatine, le contenu genique precis n’est pas toujours caracterise [3] . Nous avons realise depuis 2011 au sein du service de cytogenetique du CHU de Rennes une analyse chromosomique sur puce a ADN (ACPA) pour tous les sSMC identifies chez des patients masculins et feminins infertiles, afin de mettre en evidence la presence de genes sur ces sSMC. Sur notre cohorte de patients infertiles, 7 (4 hommes/3 femmes) presentent un sSMC, dont 4 sont en mosaique. Trois sSMC proviennent des chromosomes 15 ou 13/21 (ACPA normale). Pour 4 sSMC, l’ACPA montre un gain de materiel chromosomique : un der(1) (gain 1p121q12 de 22,5 Mb), un psu idic(14) (gain 14q11.2 d’1 Mb), un r(18) en mosaique (gain 18p11.31q11.2 de 15,2 Mb) et un idic(22) en mosaique (tetrasomie 22q11.1q11.21 de 2.5 Mb) caracteristique d’un syndrome Cat Eye de type 1. Ces gains impliquent entre 10 et 76 genes. Certains d’entre eux sont des genes candidats pour l’infertilite impliques dans la division cellulaire ou la gonadogenese (ex. : ESCO1, CABYR…) ou sont des genes connus pour etre impliques dans l’infertilite chez un individu de sexe oppose (ex. : TAF4B responsable de defaut de spermatogenese [4] present au niveau du sSMC d’un sujet feminin). Des informations additionnelles concernant les genes impliques sont necessaires pour etablir un lien clair avec le phenotype (mise en evidence d’une surexpression genique et consequences attendues dans des etudes fonctionnelles, confrontation aux donnees recentes de sequencage d’exome realise chez des patients infertiles).