Analyse d'images tridimensionnelles obtenues par microscopie confocale laser en histologie

Des analyses quantitatives tridimensionnelles (3-d) d'un tissu biologique peuvent etre effectuees a partir de coupes optiques independantes obtenues a l'aide du microscope confocal a balayage laser. Un empilement de ces coupes seriees constitue une image 3-d. Notre travail se situe dans le cadre de la quantification de ces images 3-d. Notre objectif est la conception de nouvelles methodologies permettant l'extraction et l'analyse directe de donnees 3-d. Ce double objectif nous a conduit a scinder ce travail en trois parties complementaires qui traitent respectivement des methodologies de traitement d'images et d'analyse quantitative. Dans les deux premieres parties, nous traitons les problemes d'acquisition, d'amelioration, de segmentation et de visualisation d'images 3-d. A chaque etape, des resultats obtenus a l'aide des methodes choisies sont presentes et discutes. Cette partie aborde les besoins informatiques que necessite une telle chaine technologique. La derniere partie est consacree a la description des procedures de mesures et d'analyse de donnees. Des fonctions marquees et non marquees ont ete developpees afin d'etudier les distributions d'objets dans l'espace 3-d. Une approche novatrice dans l'utilisation de l'arbre a recouvrement minimal est aussi decrite. Pour illustrer les methodes quantitatives choisies, une etude histologique de l'arrangement 3-d des noyaux de foie de rat a differents stades de developpement est presentee