Etude du mécanisme de la recombinaison homologue chez les rétrovirus

Un des facteurs majeurs generant la variabilite genetique chez les retrovirus est la recombinaison homologue. La recombinaison homologue est le resultat d'un transfert de la synthese de l'ADN, au cours de la transcription inverse, d'un ARN genomique (ARN donneur) a l'autre ARN (ARN accepteur) present dans le virion. Afin de dissequer le mecanisme de transfert de brin, nous avons developpe un systeme experimental qui permet d'etudier la recombinaison sur des sequences retrovirales in vitro. Un tiers du genome du VIH-1 a ete analyse et nous avons montre que des transferts de brin se produisaient frequemment sur la plupart des sequences etudiees. Nous avons mis en evidence, pour la premiere fois, un role des regions avoisinantes sur la capacite recombinogene d'une region donnee. La capacite de recombinaison d'une sequence donnee est dependante de la presence d'une structure en tige-boucle. Cette structure est plutot requise sur l'ARN accepteur que sur le donneur. De plus, nous avons montre que la reaction de transfert est une reaction qui passe par un intermediaire mono-moleculaire dans lequel un complexe constitue par la transcriptase inverse (RT), l'ARN donneur, l'ADN naissant et l'ARN accepteur se forme avant la realisation du transfert. Sur la base de ces resultats, nous avons construit un modele original du transfert de brin. Dans ce modele, une hybridation de l'accepteur par sa structure tige-boucle sur l'ADN naissant permet de rapprocher l'accepteur du complexe RT/ARN donneur/ADN et d'exercer une contrainte mecanique sur l'ADN qui induit une perturbation de la transcription inverse sur le donneur et aboutit a un remplacement de celui-ci par l'accepteur. Il est bien connu que le repliement de l'ARN est implique dans plusieurs processus biologiques, nous avons montre qu'elle est aussi impliquee dans le phenomene qui participe a la generation de la variabilite genetique chez les retrovirus: la recombinaison homologue.