Caractérisation par FISH, cartographie optique du génome et séquençage haut débit de génome de deux cas de triplication 16p13.11p11.2

Le bras court du chromosome 16 est caracterise par l’existence de nombreuses duplications segmentaires predisposant a des remaniements chromosomiques desequilibres par un mecanisme de recombinaison homologue non-allelique. Nous rapportons ici un nouveau desordre genomique du bras court du chromosome 16 diagnostique chez deux patientes non apparentees associant un retard du developpement psychomoteur predominant sur le langage et la marche, une hypotonie, une dysmorphie faciale ainsi qu’une surdite de transmission dans un contexte d’otites moyennes aigues recurrentes. Les deux patientes sont porteuses d’une tetrasomie 16p13.11p11.2 d’une taille de 13 Mb survenue de novo et dont les points de cassure sont localises dans des duplications segmentaires. La patiente 1 est egalement porteuse de la duplication recurrente 16p11.2 comprenant le gene SH2B1. Les etudes FISH ont montre que les 3 copies sur le chromosome 16 remanie sont disposees selon une orientation directe-inversee-directe. La position relative du locus du gene SH2B1 par rapport aux trois autres segments n’a pas pu etre etablie chez la patiente 1. Nous avons realise des analyses par cartographie optique du genome (Bionano Genomics) afin de mieux caracteriser ces variants de structure chez ces deux patientes. L’analyse des fragments de jonction nous a permis de preciser l’organisation de la region remaniee et de proposer un mecanisme a l’origine de ces desequilibres genomiques impliquant une recombinaison en U associee, dans un des cas, a une recombinaison homologue non-allelique. En raison de la localisation des points de cassure dans des duplications segmentaires, le sequencage haut debit de genome n’a pas permis de determiner l’agencement des differents segments chromosomiques remanies. Les nouvelles techniques de sequencage « long-reads » devraient etre d’un grand apport dans ce type de situation.