橄榄 CaICE1 基因的克隆和表达分析

为了解橄榄（ Canarium album ）抗寒相关转录因子ICE1的调控功能，采用RT-PCR技术克隆了‘福榄1号’的 ICE1 ，命名为 CaICE1 ，并进行生物信息学、qRT-PCR表达模式和相关miRNA预测分析。结果表明， CaICE1 cDNA序列的开放阅读框长度为1 650 bp，可编码549个氨基酸（GenBank登录号MG459422）。CaICE1为不稳定亲水性蛋白质，含有跨膜结构、磷酸化位点以及HLH保守结构域，定位于细胞核，与枳的ICE1亲缘关系较近。 CaICE1 密码子偏好性较弱，AGA、AGG、TGG和CCA可能为其最优密码子群。 CaICE1 主要在橄榄花、种子和叶中大量表达，-3℃低温胁迫下 CaICE1 表达水平比常温显著上升。psRNAtarget预测结果表明， CaICE1 可能是miR825、miR477、miR5658、miR1436和miR394等多个逆境响应miRNA的靶基因。因此， CaICE1 可能在橄榄低温胁迫过程中发挥重要调控作用，且可能受miRNA的调控。