Etude de la voie TGF∩ dans le cholangiocarcinome intrahépatique : implication des ARN longs non-codants

Le cholangiocarcinome intra hepatique (CCI) est une tumeur hepatique primitive developpee aux depens des canaux biliaires. Son pronostic est mauvais avec les traitements actuels qui augmentent peu la survie des patients. Sa cancerogenese est complexe impliquant de nombreuses voies de signalisation dont la voie TGFβ. L’hypothese du projet est l’implication des ARN longs non-codants (ARNlnc) comme mediateurs de la voie TGFβ dans le developpement du CCI. Les objectifs de notre travail etaient d’identifier des ARNlnc regules par le TGFβ et potentiels biomarqueurs diagnostiques ou pronostiques. Nous avons identifie une signature transcriptomique specifique du TGFβ apres stimulation de lignees cellulaires de CCI. Parmi les nouveaux genes cibles, plusieurs ARNlnc ont ete identifies dont CASC15 renomme TLINC pour TGFβ-induced long intergenic non-coding RNA.TLINC aurait un role dans le remodelage du microenvironnement implique dans la cancerogenese du CCI notamment par la regulation de l’IL8. Ce role pourrait s’exercer par l’interaction avec d’autres ARNlnc deja identifies dans le CCI e.g. NEAT1. TLINC est surexprime dans les tumeurs humaines de CCI et pourrait constituer un biomarqueur diagnostique. Des isoformes circulaires de TLINC mises en evidence dans les tumeurs pourraient etre detectables dans le serum et constituer des biomarqueurs non invasifs. L’analyse transcriptomique d’une cohorte de patients divisee en 2 sous-groupes de pronostic different a identifie une signature d’ARNlnc predictive de la survie. L’ARNlnc ANRIL, deja connu dans d’autres cancers, est un des ARNlnc qui pourrait constituer un biomarqueur pronostique.