水稻粒质量和粒形QTL定位及粒长位点 qGL3.2 的鉴定

目的通过水稻粒质量和粒形相关基因的QTL分析，挖掘普通野生稻（Oryza rufipogon Griff.）中优异基因，为高产水稻资源的鉴定与品种改良提供研究基础和创新材料。 方法以籼稻品种‘9311’为受体亲本，普通野生稻为供体亲本构建的染色体片段置换系群体为研究材料，考察2015、2016和2017年水稻种子千粒质量、粒长、粒宽和长宽比等性状，利用QTL IciMapping 4.1软件对控制籽粒大小的QTL进行定位分析。并利用‘9311’与小粒家系Q8衍生的次级F2群体验证第3染色体1个效应明显的QTL（qGL3.2）。 结果3年共定位到16个QTL，分布于第2、3、6、8和11染色体上，解释遗传变异的4.52%~13.08%。‘9311’与Q8家系衍生的次级F2群体验证了标记Indel3-17和RM3646之间qGL3.2位点的真实性，其对千粒质量、粒宽和长宽比的贡献率分别为33.18%、8.76%和59.92%；对粒长的效应尤为明显，LOD值高达39.29，可解释表型变异的贡献率达61.43%。精细定位和测序分析表明qGL3.2在基因Os03g0407400编码区发生1个C-A的替换，导致蛋白翻译提前终止。对130份种质资源等位变异类型和籽粒长度的分析表明C-A等位变异与粒长高度相关。 结论qGL3.2位点Os03g0407400基因C-A突变对水稻粒质量和粒形有重要影响，这为该基因的进一步育种利用和分子标记辅助选择提供依据。