Rôle des effecteurs de type III dans l'interaction Ralstonia solanacearum/aubergine : approches de génétique évolutive et fonctionnelle

Ralstonia solanacearum est une Beta-proteobacterie a la taxonomie complexe capable d'infecter 250 especes hotes et responsable du fletrissement bacterien. Pour evaluer la durabilite de resistance aux Solanacees, il semble important de comprendre le role des effecteurs de type 3 (ET3), determinants majeurs de la virulence de la bacterie dans le contournement ou l'activation de la resistance des plantes. Cette etude consiste a mettre en evidence les effecteurs impliques dans la specificite de virulence sur aubergine. Dix ET3 putativement associes a la virulence ont ete amplifies par PCR (Polymerase Chain Reaction) et sequences dans une collection de 91 souches bacteriennes. Huit genes de menages ont aussi ete amplifies et sequences afin de reconstruire la phylogenie des souches etudiees. Les phylogenies construites a partir de ces huit genes ont ete comparees a celle etablies sur les effecteurs. Vingt souches representatives de la diversite de repartition des effecteurs ont ete selectionnees pour une inoculation en conditions controlees sur des cultivars d'aubergines resistants E6 et sensible E8. Six mutants defectifs ont egalement ete inocules sur E6 et E8 pour estimer leur implication dans l'avirulence sur E6. Les resultats obtenus mettent en evidence un ET3 conserve chez toutes les souches et des ET3 a repartition variables selon les souches. La distribution des effecteurs etudies se structure en onze profils et un polymorphisme de taille des ET3 a ete detecte. Les analyses phylogenetiques revelent des cas d'incongruence pour trois effecteurs (sur cinq analyses) suggerant des evenements de recombinaison. Enfin les resultats d'inoculation des mutants montrent que cinq effecteurs pourraient etre reconnus par les mecanismes de la plante conduisant a la resistance durable de E6. (Resume d'auteur)