Diversité des aphyllophorales impliquées dans la dégradation du bois

Le bois possede une structure tres complexe. Les particularites de son organisation cellulaire, sa composition chimique et l'identite genetique de chaque espece conditionnent ses proprietes parmi lesquelles sa sensibilite vis-a-vis des agents biologiques. Champignons et insectes attaquent le bois, brisant sa structure cellulaire en alterant ses caracteristiques physiques et esthetiques. Les champignons de pourritures cubique, fibreuse ou molle, en utilisant les differents constituants du bois comme source carbonee, engendrent sa degradation en provoquant des alterations profondes et irreversibles de toutes ses proprietes, couleur, durete, proprietes mecaniques. Ces proprietes catalytiques fondamentales au bon fonctionnement de la plupart des ecosystemes terrestres representent une nuisance grave pour les bois mis en service. Mieux connaitre les organismes impliques dans ces degradations afin de s'en proteger pour assurer la durabilite du bois mis en service doit permettre de determiner l'exacte quantite du pesticide requis pour une preservation du bois efficace et respectueuse de l'environnement. Pour cela, le CIRAD-Foret a entrepris une caracterisation moleculaire des 800 souches de sa collection de champignons lignivores. Ainsi, les regions de l'ADN ribosomique nucleaire comprenant les parties ITS1, ITS2 et 5,8S de 103 Aphyllophorales ont ete amplifiees par PCR en utilisant les amorces ITS1 et ITS4. L'analyse des poids moleculaires des amplifiats a permis de mettre en evidence un polymorphisme de longueur de cette region permettant de definir deux principaux groupes d'isolats: un premier avec un ITS ayant une longueur voisine de 635 paires de bases et un second avec une longueur voisine de 725 paires de bases. L'utilisation d'enzymes de restriction a permis de preciser la caracterisation de ces isolats et d'en reveler la diversite. Enfin, le sequencage des amplifiats obtenus avec les amorces ITS1 et ITS4 a ete realise sur 69 souches parmi les 103 initialement etudiees. Les comparaisons de ces sequences entre-elles et avec des sequences de la base de donnees NCBI ont permis de mettre en evidence des variabilites inter et intraspecifiques importantes, de nature a remettre en cause la determination des souches ou la systematique de certains groupes comme tes Spongipelis spp. et les Antrodia spp. Par ailleurs, le positionnement phylogenetique de ces differents groupes met en evidence des clusters de souches de pourriture cubique distinct des clusters de souches de pourritures fibreuses. (Texte integral)