Pedigree analysis of the Afrikaner cattle breed

espanolLa reduccion de la variabilidad genetica en el ganado vacuno de carne ha sido investigada ampliamente a nivel mundial. Sin embargo, la variabilidad genetica y la endogamia de las razas autoctonas del ganado vacuno de carne del Sur de Africa, conocido como ganado Sanga, han sido estudiadas en mucha menor medida. Entre las razas de ganado bovino Sanga, se encuentran las razas Afrikaner, Drakensberger y Nguni. En los ultimos anos, el censo de ganado Afrikaner y el numero de explotaciones que lo crian han disminuido. Nuestro objetivo fue el de determinar el nivel medio de endogamia (F), el tamano efectivo de la poblacion (Ne) y los intervalos generacionales del ganado Afrikaner, empleando para ello su registro genealogico. Se analizaron un total de 244 714 registros, que iban de 1940 a 2011. El coeficiente medio de endogamia fue de 1.83 por ciento y el tamano efectivo de poblacion fue de 167.54. El intervalo generacional medio ascendio, segun los calculos, a 6.6 ± 3.9 anos. Los niveles de endogamia arrojados por el analisis genealogico de la poblacion bovina Afrikaner parecen aceptables y manejables. En consonancia, el gran tamano Ne conlleva una baja tasa de cambio en el coeficiente F. Los resultados del estudio actual pueden ser utilizados por los ganaderos y por la asociacion de criadores para conservar la raza Afrikaner y emplearla hasta su pleno potencial en la era del cambio climatico. francaisLa reduction de la variabilite genetique chez les bovins a viande a fait l’objet de nombreux travaux de recherche a l’echelle mondiale. Pourtant, la variabilite genetique et la consanguinite ont a peine ete etudiees chez les races autochtones de bovins a viande du Sud de l’Afrique, regroupes sous le nom de Sanga. Parmi les races du rameau bovin Sanga, se trouvent les races Afrikaner, Drakensberger et Nguni. Ces dernieres annees, l’effectif de bovins Afrikaners et le nombre d’eleveurs de cette race ont diminue. Notre objectif a ete de determiner le niveau moyen de consanguinite (F), la taille effective de la population (Ne) et les intervalles generationnels des bovins Afrikaners, en se servant pour cela du registre genealogique de la race. Un total de 244 714 inscriptions faites de 1940 a 2011 ont ete analysees. Le coefficient moyen de consanguinite et la taille effective de la population ont ete respectivement de 1.83 pour cent et 167.54. L’intervalle generationnel moyen a ete de 6.6 ± 3.9 ans, d’apres les calculs. Les niveaux de consanguinite deceles par l’analyse genealogique de la population bovine Afrikaner semblent acceptables et maitrisables. En fait, la grande taille Ne entraine un faible taux de changement pour le coefficient F. Les resultats de cette etude peuvent etre utiles a l’association d’eleveurs dans le but de conserver la race Afrikaner et de l’utiliser jusqu’a son plein potentiel a l’ere du changement climatique. EnglishThe reduction of genetic variability in beef cattle has been extensively researched on a global scale. However, the genetic variability and inbreeding of indigenous cattle breeds of Southern Africa, referred to as Sanga cattle, has been less well characterized. Breeds of Sanga cattle include Afrikaner, Drakensberger and Nguni breeds. In recent years, the number of Afrikaner cattle and herds has decreased. Our objective was to determine the mean level of inbreeding (F), effective population size (Ne) and generation intervals of Afrikaner cattle using their recorded pedigree. A total of 244 718 records extending from 1940 until 2011 were analysed. The average inbreeding coefficient was 1.83 percent and the effective population size was 167.54. The average generation interval was calculated as 6.6 ± 3.9 years. Pedigree analysis on the Afrikaner cattle population yielded levels of inbreeding that appear to be both acceptable and manageable. By implication, the large Ne results in a low rate of change in F. Current results study can be utilized by farmers and the breeders’ society to conserve the Afrikaner and utilize the breed to its full potential in the era of climate change