Diagnostic de la fusariose invasive par détection d’ADN circulant : analyse rétrospective de 9 cas prouvés

Introduction Fusarium spp. est un agent fongique phytopathogene et emergent en pathologie humaine chez les patients severement immunodeprimes et grands brules. Les fusarioses invasives restent associees a une importante morbi-mortalite en lien avec un diagnostic difficile en l’absence de culture positive. L’objectif de notre etude est d’evaluer la detection d’ADN circulant de Fusarium spp. pour le diagnostic precoce des fusarioses invasives. Materiels et methodes Cette etude retrospective multicentrique (6 centres) evalue une PCR specifiquement developpee et optimisee pour identifier toutes les especes de Fusarium spp. Un total de 9 patients diagnostiques avec une fusariose prouvee selon les criteres EORTC/MSG entre 2015 et 2021 ont ete inclus. Des patients presentant d’autres infections fongiques (aspergilloses, n = 4; mucormycoses, n = 4; et candidemies, n = 3) n’en presentant pas (n = 10) ont ete inclus comme temoins negatifs. Resultats Aucune reaction croisee n’a ete detectee par l’etude de 81 ADN d’especes de champignons opportunistes. Toutes les souches (n = 19) provenant de 5 complexes d’especes de Fusarium spp. impliques en pathologie humaine (complexe dimerum, solani, oxysporum, fujikuroi et incarnatum) ont ete detecte. La limite de detection est evaluee a 3.2-32 femtogram/μL en fonction des especes. L’ADN circulant etait detecte dans le sang de 8 patients sur 9 jusqu’a 10 jours (mediane = −1 [−10; 3]) avant le diagnostic confirme par une hemoculture ou biopsie positive. Les biopsies disponibles (n = 2) de nodules sous-cutanees dans le cas de fusarioses disseminees ont egalement permis de detecter l’ADN de Fusarium spp. Des prelevements iteratifs chez un patient ont mis en evidence une persistance de la detection d’ADN jusqu’a 8 jours apres la mise sous traitement (voriconazole). L’ADN de Fusarium spp. n’a pas ete detecte chez un patient presentant une hemoculture positive a Fusarium verticilloides mais nous n’avons pas pu analyser de serum preleve le jour de la premiere hemoculture positive et apres. L’ADN extrait de la souche isolee de l’hemoculture chez ce patient est cependant amplifie par cette PCR. Aucun prelevement des patients temoins n’a ete amplifie. Conclusion Nous avons developpe une PCR specifique Fusarium spp. dont les caracteristiques montrent une sensibilite et specificite de 88,9 et 100 %, respectivement. Compte tenu de l’anciennete des prelevements utilises et des quantites sub-optimales de serum extraites, cette sensibilite est certainement sous-estimee et pourra etre reevaluer a l’occasion d’une etude prospective prevue dans les mois/annees a venir. La detection d’ADN circulant specifique de Fusarium spp. semble etre, a l’instar de la PCR Mucorales, une technique non-invasive, sensible et specifique et pourrait permettre un diagnostic precoce et un suivi des fusarioses invasives. Ce nouvel outil moleculaire est d’ores et deja disponible sur demande specifique.