Analysis of the DNA microarray hybridization images using morphological image processing

Streszczenie: W artykule przedstawiono u yteczno morfologicznego przetwarzania obrazow w analizie obrazow hybrydyzacji mikromacierzy DNA. Zostanie zaproponowany wykorzystuj cy morfologiczn kowariancj i rekonstrukcj morfologiczn algorytm automatycznego pozycjonowania spotow. Przedstawiony algorytm umo liwia okre lenie w latwy sposob dwoch wa nych parametrow obrazu hybrydyzacji: redniej odleglo ci mi dzy spotami oraz redniej warto ci erozji tla. Abstract: This paper presents the usefulness of the morphological image processing in analysis of the DNA microarray hybridization pictures. The algorithm for automatic spot positioning based on the morphological covariance and morphological reconstruction will be proposed. The algorithm presented here makes it possible to easily determine two important parameters of the microarray image: mean distance between spots and mean value of the background erosions