Evaluation de la diversité métabolique de dégradation des HAPs et de leurs métabolites par les communautés microbiennes de divers sols de friches industrielles

La biodegradation des composes aromatiques polycycliques (CAPs) et notamment des hydrocarbures aromatiques polycycliques (HAPs) est tres etudiee du fait de la distribution ubiquitaire de ces composes, de leur persistance dans les sols et de leur toxicite pour la sante humaine. Au cours de ce stage, la mise au point d'une technique utilisant les microplaques Biolog MT2 a ete realisee dans le but d'evaluer le potentiel metabolique de degradation de communautes microbiennes de differents sols vis-a-vis d'un panel de composes aromatiques parmi lesquels des HAPs, des CAPs polaires et des metabolites intermediaires et finaux de degradation des HAPs. Cette technique a permis de tester ce potentiel metabolique pour les communautes microbiennes d'un sol re-contamine par plusieurs composes aromatiques (HAPs ou metabolites) et de differents sols sous l'influence ou non de la presence de plantes. Bien que certains biais relatifs a l'utilisation de la microplaque Biolog aient ete rencontres, les resultats montrent que cette technique permet de mettre en evidence des changements du profil de degradation selon les conditions testees. On constate que la re-contamination du sol avec du phtalate, du fluorene ou du 9-fluorenone diminue le potentiel metabolique de degradation des communautes microbiennes du sol pour au moins 4 composes aromatiques et a l'inverse que la recontamination avec du phenanthrene ou du 1-hydroxy-2-naphtoate ameliore le potentiel de degradation des communautes pour au moins 5 composes. En outre, la presence de plantes entraine une augmentation du potentiel metabolique de degradation dans les sols de Homecourt et Joeuf (54, France). Les resultats montrent egalement que 3 sols, aux niveaux de pollution en HAPs variables, possedent des profils metaboliques differents. La spectrometrie de fluorescence a permis de confirmer le potentiel metabolique du sol de Neuves-Maisons vis-a-vis du phenanthrene. Par ailleurs ces resultats ont ete mis en relation avec la quantification de divers genes marqueurs phylogenetiques (ADNr 16S et ADNr 18S) et fonctionnels (HAP-dioxygenases). Bien que les diverses re-contaminations du sol ne modifient pas les densites bacteriennes et fongiques, la re-contamination avec du pyrene entraine une augmentation de l'abondance des HAP-dioxygenases des bacteries a Gram positif.