Paléogénomique des dynamiques des populations humaines sur le territoire français entre 7000 et 2000 avant le présent

Ces derniers 10000 ans en Eurasie occidentale ont ete marques par des transitions culturelles qui ont profondement transforme les societes humaines : l’apparition et la diffusion du Neolithique, de l’Âge du Bronze et de l’Âge du Fer. La paleogenomique, en analysant les genomes anciens, s’est attelee a en decrire les processus demographiques sous-jacents dans diverses parties du continent. En France cependant, la fin de la Prehistoire est seulement connue par le biais de l’archeologie, et n’a pas encore ete exploree par la genetique a l’echelle du territoire. Nous avons produit un large jeu de donnees comprenant les genomes mitochondriaux, marqueurs du chromosome Y et genotypes d’une selection de loci nucleaires d’interet via une procedure d’enrichissement pour 193 individus datant du Mesolithique, Neolithique, Âge du Bronze et Âge du Fer a travers le territoire de la France actuelle. Nous avons egalement genere les genomes a faible couverture de 58 individus repartis sur les memes periodes et recouvrant partiellement ce panel. L’integralite de ces resultats offre, pour la premiere fois, un apercu des dynamiques des lignees maternelles et paternelles ainsi que du genome nucleaire sur une periode recouvrant 5000 ans. Que ce soient les lignees parentales ou le genome, differentes dynamiques apparaissent entre le nord et le sud de la France durant le Neolithique, avec un degre variable d’incorporation des populations de chasseurs-cueilleurs autochtones dans les communautes de fermiers. Ils mettent egalement en evidence, peu avant le debut de l’Âge du Bronze, un flux de genes domine par des hommes dont la signature genetique des bergers de la Steppe Pontique, une signature qui ensuite persiste durant l’Âge du Fer, alors que la population montre peu de differentiation a l’echelle du territoire francais. Certains marqueurs phenotypiques observes au Neolithique arborent une frequence proche de celle observee dans la population europeenne actuelle, indiquant des episodes de selection positive pre-datant le Neolithique, tandis que d’autres montrent des frequences differentes, signe d’une selection en cours sur ces loci. Cette etude accroit notre comprehension de relations entre les differentes populations de la fin de la Prehistoire, a l’echelle de la France et de l’Europe.